目前世界上已知最大的微生物:1985年Fishelson、Montgomery及Myrberg三人發現一種生長于紅海水域中的熱帶魚(名叫surgeonfish)的小腸管道中的微生物費氏刺骨魚菌(Epulopiscium fishelsoni)，這是當時世界上所發現最大的微生物。它外形酷似雪茄煙，長約200~500μm，最長可達600μm，體積約為大腸桿菌的100萬倍，這種微生物并不需要由顯微鏡觀察便可直接由肉眼察覺到它的存在。目前最大的微生物則是1997年，由Heidi Schulz在納米比亞海岸海洋沉淀土中所發現的呈球狀的細菌，直徑約100~750μm。這比之前所提的微生物大上2~4倍。2011年9月我國科學家在海南發現世界最大真菌子實體，該子實體已生長了20年，長度超過10米，寬度接近1米，厚度在5厘米左右，體積為409262–525140立方厘米，重量超過500千克。

目前世界上已知最小的能獨立生活的微生物:支原體，過去也譯成"霉形體"，它是一類介于細菌和病毒之間的單細胞微生物，是地球上已知的能獨立生活的最小微生物，大小約為100納米。支原體一般都是寄生生物，其中最有名的當屬肺炎支原體(M.Pneumonia)，它能引起哺乳動物特別是牛的呼吸器官發生嚴重病變。

病毒:最小的植物病毒，萵苣花葉病毒，粗1.5納米，長28納米;最小的動物病毒，口蹄疫病毒，直徑只有2.1納米。

亞病毒:(包括類病毒、擬病毒、朊病毒)是世界上最小的微生物。擬病毒的大小和類病毒相似;朊病毒比已知的最小的常規病毒還小得多(約30~50nm);類病毒是目前已知最小的可傳染的致病因子，比普通病毒簡單，1971年首次報道的馬鈴薯紡錘形塊莖病類病毒，它的大小只有萵苣花葉病毒的三十九分之一。

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